西北一‘’，新疆也跟着‘’了起来，不过前期一直是各大领主内掐来掐去，没想到掐架吃亏了的喀什回首领柯尔克孜伯克司迪尔，派人去浩罕汗国叫帮手了。这帮大哥可没有国界的概念，对于他们来说，大清这边都是可恶的异教徒，葱岭西边那些人才是和他们一个信仰的自己人。所以浩罕汗国的外国人阿古柏，护送着张格尔的儿布素鲁克，又回到了新疆。回来的第一件事，是把请他们来的司迪尔给赶了新疆。

大清与浩罕汗国在新疆的纷争，很难说的清楚，因为大清认为这是国与国之间的政治问题，浩罕汗国却认为这是他们的宗教事务。也不止是浩罕汗国，几乎整个阿拉伯世界都这么认为，只要是*的事，他们得着。虽然后来大清也接受了浩罕汗国的想法，但是大清的法却二到了极，同意外国人理本国宗教事务，完全是自己给自己找不自在。这次西北回‘’，便成了不自在凸显的契机，大清还只是遇到了*烦，浩罕汗国则把自己给坑死了。

打通了东西方的贸易路线，获得了大量的经济利益。因为其与清朝的关系愈加密，浩罕商人垄断了新疆的贸易，使得浩罕汗国成为了亚最大的贸易国。当时亚市场通的金银装饰，武甚至日用品都是由浩罕汗国所垄断。除此之外，从国到西方的茶叶，丝绸，陶瓷等等，也都要通过浩罕汗国。伴随着经济的增长，浩罕汗国也摆脱了于边境地区荒芜的面貌，加速了社会基本设施的建设，逐渐成为了该地区军事·宗教·商业的心。

张格尔之‘’引发了几十年未遇的新疆大规模叛‘’，起初清朝毅然与浩罕汗国断‘’，但是这次大叛‘’也给清朝在新疆的统治带来了很大打击，使得清政fǔ不得不考虑与浩罕汗国相妥协。光十年，清朝与浩罕汗国议和，同意了浩罕汗国向新疆六城地区派遣长老，行使领事特权的要求。通过派遣长老，浩罕汗国可以一面保护浩罕商人在新疆的利益，同时直接对浩罕商人征税，从而保证浩罕汗国垄断在六城地区的贸易利益。但是浩罕汗国还是没有放弃其对喀什地区的野心，时常支持和卓族人的复国行动，介新疆事务。

本来阿古柏还得几年才能凭借英国人援助的武，完成对新疆的全面侵略，建立自己的汗国，顺便坑死浩罕汗国，但是果兴阿与俄国的‘激’战改变了他的命运。

‘混’的壮了，自然想把地盘的大一，浩罕汗国把目光投向了大清的袋里的喀什地区。找大哥单练浩罕汗国还没这个勇气，但是玩损的他们还是敢的，如支持新疆地区的同教兄弟叛‘’。浩罕一直支持新疆地区的同教兄弟反抗清廷统治，之前拒绝引渡大和卓之萨木克，并在英国支持下为萨木克策划复国。萨木克死后，穆罕默德·阿里汗又支持大和卓的孙张格尔疆建立赛义德·张格尔苏丹国，并兵叶尔羌地区。